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中国工程院院士、河海大学长江保护与绿色发展研究院院长张建云认为，我国抗生素监管存三大难题：一是污染管控起步较晚，药品产用登记体系缺乏，负荷估算难；二是环境科学与水文学脱节，过程追溯难；三是污水深度处理工艺缺失，负荷削减难。

“各年龄阶段和各人群的抗生素暴露状况，抗生素暴露对儿童与人群健康的影响及机制，来自环境和食品的抗生素暴露对人群微生物组耐药的影响等，目前都缺乏研究。”复旦大学公共卫生学院原院长姜庆五教授说。

相关专家呼吁，抗生素污染风险事关人民群众身体健康和中华民族长远发展，应尽快修订标准、严控源头、加强研究，管控长江流域的抗生素污染。

加强抗生素监测能力建设，修订相关标准。张建云院士指出，目前仍没有关于地表水环境中抗生素赋存水平限值的强制标准，建议在国家关键控制断面水环境监测平台中，将抗生素纳入监测指标，并在现行生活饮用水标准中增加典型抗生素参考指标及限值控制性指标。

从源头减少抗生素使用和排放。河海大学党委书记、长江保护与绿色发展研究院执行院长唐洪武教授建议，健全抗生素使用登记与排放管控机制，建立我国流域抗生素污染源清单数据库，重点监控抗生素负荷贡献较大的关键风险源，如制药厂、养殖场等。同时，指导养殖业从业人员合理使用抗生素，减少使用剂量，杜绝使用已禁用的抗生素。

加强抗生素污染对健康与食品的影响研究，提高污染处理能力。姜庆五教授建议，全面评价环境抗生素残留和人体抗生素暴露状况及对健康的影响，尤其关注对儿童生长发育的影响，研究环境抗生素残留对人群细菌耐药性和对人群健康的影响及其机制，为养殖、卫生监察、食品加工、环境监管政策提供可靠的基础数据和理论依据。